Kejsarn av Portugallien handlar om den fattige torparen Jan i Skrolycka som hyser en sällan skådad faderskärlek till dottern Klara Fina Gulleborg, döpt efter självaste solen.
När dottern lämnar familjen för den stora staden drivs Jan in i en fantasivärld. Där är dottern kejsarinna av Portugallien, ett underbart paradis där inga sociala orättvisor finns. Plötsligt slutar han anpassa sig till ortens sociala hierarkier och börjar istället att ta sin plats.